Как и где в программе внести транспортные расходы и страхование??

Если указанные затраты относятся к фактурной стоимости (прописаны в инвойсе):
Значения необходимо внести в блок гр.22, состоящую из трех строк, заполняете кроме "Загальна вартість...", еще "Транспортування" и "Надбавки/Страхування" (См. в окне редактирования блок под гр.29,30, который начинается с ячеек "Курс USD" и "Курс EUR").

Если указанные затраты влияют на формирование таможенной стоимости (НЕ прописаны в инвойсе, отдельная справка о затратах):
Значения ​необходимо внести в блок гр.12 (таможенная стоимость). В гр. 12 левее кнопки "Декларація митної вартості" откройте закладку "Дополнительные затраты", в открывшемся списке вносите суммы затрат на транспортировку и страховку.