долго присоединяются документы

Если такое происходит при отправке:  программа "читает" файл- сканкопию документа, затем его кодирует и помещает в электронную копию. Если вирус очень "активный", то понятно, что программа получит доступ к этому файлу только после того, как отработает антивирус, а если у него еще и эвристический анализатор (технология поиска возможного "вируса") включен, то процесс может затягиваться.

Если же речь идет только о выборе присоединяемого файла, то похожее поведение может быть в случае, если файл на флешке - сначала антивирус сканирует весь накопитель и только потом программа получает управление. Возможна также задержка если файл находится на сетевом диске - открытие каталога для выбора файла может происходить с задержкой. 

В открытой декларации сам файл не присоединяется, в 44 графе указан только путь к файлу, документы присоединяются только в режиме отправки декларации. Скажите еще пожалуйста, а что у Вас с правами доступа на компьютере?